La seguridad pasiva comprende todas aquellas medidas destinadas a proporcionar protección durante un accidente. Entre ellas se encuentran los reposacabezas NECK-PRO de serie para conductor y acompañante. En caso de colisión por alcance, sus sensores hacen que se coloquen en posición vertical en milésimas de segundo, reduciéndose la distancia con la cabeza del ocupante.

La Clase S incorpora de serie ocho airbags, entre ellos dos windowbags que cubren prácticamente toda la zona de las ventanillas. La evolución más notable afecta a los sensores de activación de los airbags frontales. La denominada clasificación por peso hace posible que los sistemas de retención brinden al acompañante una protección adecuada. Con ello, la Clase S establece una nueva tendencia dentro de la tecnología de la seguridad: la individualización de los sistemas de retención. También los airbags laterales y windowbags se benefician de los avances técnicos. En la Clase S se incorporan, por primera vez en un Mercedes-Benz, sensores de presión: si la puerta se deforma debido a un impacto lateral, aumenta la presión del aire contenido entre el revestimiento de chapa y el interior de la puerta. Los sensores registran esta modificación y asisten a la unidad de control en la activación de los airbags laterales y windowbags.

Otro aspecto importante es la contribución a la seguridad de otros usuarios de la vía, por ejemplo, con una carrocería de superficies lisas que cede a los golpes de forma selectiva.